El dentista, mediante la exploración clínica, análisis de la oclusión y las pruebas complementarias radiológicas y de laboratorio que precise, valorará el grado de afectación de cada uno de los componentes del sistema e instaurará el tratamiento más adecuado.

El tratamiento de las disfunciones craneomandibulares resulta más difícil cuanto más crónica es la disfunción.